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关于装农药的纸盒子是否有毒，以及其与烟盒与农药灌装线的距离问题，可以分析如下：
1、农药纸盒子是否有毒：这主要取决于盒子的材质和农药的残留情况，如果纸盒是专业用于包装农药的，其材质可能经过特殊处理，以抵抗农药的侵蚀，减少农药残留，降低毒性，但若是普通纸盒被不当用来包装农药，可能会有较大的农药残留，其毒性相对较高，即使农药包装完整无损，一旦纸盒长时间存放农药，仍有可能受到农药渗透的影响，导致有毒物质渗出，不建议随意使用纸盒子来存放农药，更不可随意将其与食品等接触。
2、与烟盒和农药灌装线的距离：农药纸盒子在灌装、包装、运输过程中可能存在农药泄露的风险，为确保安全，烟盒与农药灌装线的距离应保持一定距离，避免农药污染烟盒或其他产品，具体的距离标准可参照相关的安全生产和环保规定。
处理农药包装时，应特别小心谨慎，避免农药泄露导致的污染和安全隐患，如需了解更多关于农药安全使用的信息，建议咨询农业专家或相关机构。